środa, 5 czerwca 2013

TRANSKRYPCJA (POWSTAWANIE RNA)

Proces tworzenia RNA na matrycy DNA. Zachodzi w całej interfazie. Do transkrypcji służą geny, czyli małe fragmenty DNA.
Gen – mały fragment DNA na matrycy którego powstaje RNA; fragment ten decyduje o powstawaniu jakiegoś białka w komórce.
Transkrypcja może zachodzić w miejscu występowania DNA, czyli w jądrze komórkowym, mitochondriach, chloroplastach.
Proces transkrypcji ma wiele cech podobnych do replikacji, tyle, że replikacja zachodzi na całej cząsteczce DNA, a transkrypcja na małym fragmencie (genie). W procesie tym bierze udział jeden z łańcuchów DNA.
     ·         Nić sensowna – biorąca udział w transkrypcji
     ·         Nić antysensowna – nie bierze udziału w transkrypcji
W procesie tym biorą udział podobne enzymy, czyli helikaza i polimeraza RNA.
Podwójna helisa za sprawą helikazy rozkręca się na pewnym fragmencie.
Nić sensowna to nić 3’ -- > 5’, bo polimeraz tworzy nić od 5’ do 3’ i na niej zachodzi transkrypcja.
W skutek działania polimerazy  powstaje pre mRNA.
GGACTACCGCTTAATCA – prekursor mRNA (heterogenny RNA)
Pre mRNA ulega obróbce po transkrypcyjnej, podobnie jak reszta transkrypcji ma miejsce w jądrze.
Na matrycy genu są fragmenty:
      ·         Eksony – fragmenty kodujące białko
      ·         Introny – fragmenty niekodujące białko
Pre mRNA w jądrze ulega obróbce po transkrypcyjnej, bo już w DNA są części niekodujące – introny, rozdzielające eksony.
Po transkrypcji introny są wycinane, a pozostałe eksony są łączone (zszywane) za pomocą enzymu z grupy ligaz – splazing.
Splazing może być alternatywny.

Zaobserwowano, że podczas obróbki po wycięciu intronów eksony ułożone są w różny sposób co wpływa na różnorodność genetyczną.
Po wycięciu intronów i złączeniu eksonów ostateczny mRNA w jądrze otacza się białkiem. Płaszcz białkowy pełni rolę ochronną przed rybonukleazami.
Rybonukleazy  - enzymy niszczące i rozcinające fragmenty RNA, są po to by niszczyć obce RNA np. wirusowe.
W tej postaci jako informosom (ostateczny mRNA otoczony płaszczem białkowym) przez pory jądrowe wychodzi do cytoplazmy.
W komórce eukariotycznej transkrypcja i translacja są rozdzielone czasowo i przestrzennie.
U bakterii nie ma rozdzielenia czasowego i przestrzennego. U nich toczy się transkrypcja i jeszcze nie dobiegnie końca, a RNA już łączy się z rybosomami, bo:
     ·         Mają naga nić DNA
     ·         Nie mają jądra komórkowego

     ·         Nie ma obróbki po transkrypcyjnej, co znaczy, że nie ma u nich intronów i eksonów. 

poniedziałek, 29 kwietnia 2013

BUDOWA I RODZAJE KWASÓW RNA


Kwasy RNA zbudowane są z :
    ·         4 zasady azotowe: adenina, guanina, cytozyna, uracyl
    ·         Cukier ryboza
    ·         Reszta kwasu H3PO4

Kwasy RNA powstają na matrycy kwasów DNA w procesie transkrypcji.

Rodzaje kwasów RNA:
    ·         mRNA (matrycowy, informacyjny)
    ·         rRNA (rybosomalny)
    ·         tRNA(transferowy, transportujący)
tRNA jest wyjątkowym RNA, bo jego fragmenty stworzyły komplementarne pary, między A–U i C–G

tRNA jest najmniejszy ze wszystkich RNA nie buduje go więcej niż 80 nukleotydów.
tRNA przyjmuje taką formę, bo naprzeciw siebie leżą komplementarne nukleotydy i mogą powstawać między nimi wiązania wodorowe.

Otwarte pętle są to miejsca niekomplementarne.

Antykodon w każdym tRNA jest inny i jest 61 możliwości antykodonu; składa się on z nukleotydów na środkowej pętli .

tRNA – odpowiada za transport aminokwasów z cytoplazmy komórki do rybosomów. Od kodonu zależy to jaki aminokwas transportuje.